1911年九月紹興光復(fù),任紹興師范學(xué)校校長。1912年一月一日,臨時(shí)政府成立于南京,應(yīng)教育總長蔡元培的招募,任教育部部員。五月,航海到達(dá)北京,住宣武門外南邊的半截胡同紹興會(huì)館藤花館,任教育部社會(huì)教育司第一科科長。八月任命為教育部僉事。1917年七月初,因張勛復(fù)辟亂作,憤而離職,亂平之后就返回了教育部。1920秋季,兼任北京大學(xué)及北京高等師范學(xué)校講師。1923年秋,兼任北京大學(xué),北京師范大學(xué),北京女子高等師范學(xué)校及世界語專門學(xué)校講師。1925年八月,因教育總長章士釗非法解散北京女子師范大學(xué),魯迅與多數(shù)教職員有校務(wù)維持會(huì)的組織,被章士釗違法免職。隨后魯迅向?qū)9苄姓V訟的平政院投遞訴狀,控告章士釗濫用職權(quán)。1925年秋,兼任北京大學(xué),北京女子師范大學(xué),中國大學(xué)講師,黎明中學(xué)教員。1926年一月,新任教育總長易培基取消過去對(duì)魯迅的免職處分,教育部僉事職務(wù)恢復(fù)。二月,平政院開會(huì)作出裁決,正式取消章士釗對(duì)魯迅的處分,判定魯迅訴勝。三月,“三一八”慘案后,避難入山本醫(yī)院,德國醫(yī)院,法國醫(yī)院等,至五月始回寓。八月底,離北京向廈門,任廈門大學(xué)文科教授。十二月因?qū)W(xué)校不滿,辭職。